乳酸是CHO細胞補料分批培養(yǎng)的主要副產(chǎn)品之一。在 pH 控制的生物反應器中, 由于添加堿以控制細胞培養(yǎng)基的 pH值,高水平乳酸的積累伴隨著高滲透壓,可能導致制造細胞生長緩慢,甚至大量凋亡,同時產(chǎn)生抗體蛋白的產(chǎn)量也降低不少。而 乳酸脫氫酶 (LDH) 是一種催化底物丙酮酸轉(zhuǎn)化為乳酸的酶,包括丙酮酸濃度在內(nèi)的許多因素都會調(diào)節(jié) LDH 活性。
乳酸脫氫酶對代謝產(chǎn)物的影響
在一項研究中,科學家們曾嘗試敲低乳酸脫氫酶 A (LDHa) 和 PDHK 的基因表達,以研究對乳酸代謝和蛋白質(zhì)生產(chǎn)的影響。他們發(fā)現(xiàn),使用攜帶 LDHa 和 PDHK 的小抑制性 RNA (siRNA) 的單個靶向載體,可以成功地同時下調(diào) LDHa 和 PDHK。此外,他們使用 siRNA 介導的 LDHa/PDHKs 敲低克隆的分批補料搖瓶評估數(shù)據(jù)顯示,在表達治療性單克隆抗體的 CHO細胞中下調(diào) LDHa 和 PDHKs會減少乳酸產(chǎn)量,增加比生產(chǎn)率和體積 抗體產(chǎn)量分別減少約 90%、75% 和 68%,對細胞生長沒有明顯影響。從在生物反應器中進行的評估中也觀察到 siRNA 克隆平均較低乳酸水平和較高抗體生產(chǎn)率的類似趨勢。
降低CHO細胞培養(yǎng)中的乳酸水平的方法
生物制藥蛋白質(zhì)產(chǎn)品市場正在快速增長,在2010年時已經(jīng)達到 700 億美元。由于對功能性蛋白質(zhì)的需求增加,需要開發(fā)技術以實現(xiàn)更高的生產(chǎn)率。為實現(xiàn)這一目標,已經(jīng)在 CHO細胞中探索了包括宿主細胞工程在內(nèi)的不同方法。CHO 細胞廣泛用于生產(chǎn)治療性蛋白質(zhì),包括在具有受控 pH 值的生物反應器中使用分批補料工藝生產(chǎn)重組單克隆抗體。乳酸是補料分批培養(yǎng)過程中積累的主要副產(chǎn)物之一,已表明高乳酸水平會抑制細胞生長和蛋白質(zhì)生產(chǎn)。 生物反應器中葡萄糖乳酸指標分析一般使用EKF Biosen C-Line 乳酸分析儀來在線測定,培養(yǎng)過程中多數(shù)選用通過調(diào)節(jié)培養(yǎng)基中的堿度的方式來維持適宜細胞生長的PH環(huán)境。但是,乳酸分泌和向培養(yǎng)基中增加堿這兩者都會導致滲透壓增加,從而抑制細胞生長并導致抗體生產(chǎn)率降低。因此,降低乳酸水平對于開發(fā)穩(wěn)健且高效的抗體生產(chǎn)過程是可取的。乳酸分泌和向培養(yǎng)基中增加堿以維持 pH 值會導致滲透壓增加,從而抑制細胞生長并導致抗體生產(chǎn)率降低。因此,降低乳酸水平對于開發(fā)穩(wěn)健且高效的抗體生產(chǎn)過程是可取的。乳酸分泌和向培養(yǎng)基中增加堿以維持 pH 值會導致滲透壓增加,從而抑制細胞生長并導致抗體生產(chǎn)率降低。因此,降低乳酸水平對于開發(fā)穩(wěn)健且高效的抗體生產(chǎn)過程是可取的。
有許多因素會影響哺乳動物細胞培養(yǎng)物中的乳酸生成,包括丙酮酸的細胞內(nèi)濃度。丙酮酸是 LDH 和 PDH 的底物,是決定消耗的碳源是通過糖酵解氧化后作為乳酸排出還是在 TCA 循環(huán)中進一步代謝的關鍵分支點。LDH 在催化丙酮酸和乳酸轉(zhuǎn)化的同時也催化 NADH 和 NAD+ 的相互轉(zhuǎn)化。在哺乳動物細胞中,LDH 以同源或異源四聚體的形式存在,主要由 LDHa 和 LDHb 基因編碼的 A 和 B 亞基組成。在 CHO 細胞中,LDH 同種型已被證明是 A3B 和 A2B2 四聚體的中間體。
PDH 復合體活性的調(diào)節(jié)方法
PDH 復合體是一種多酶單位,由三種催化酶 E1、E2 和 E3 組成。該復合物催化將丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙酰輔酶 A 的限速反應,乙酰輔酶 A 是三羧酸 (TCA) 循環(huán)的入口點。PDH 的活性受 PDHK 和丙酮酸脫氫酶磷酸酶 (PDHP) 的調(diào)節(jié)。PDHK 磷酸化 PDH 以抑制其酶活性,而 PDHP 去磷酸化并因此激活 PDH 酶活性。哺乳動物細胞中有四種 PDHK 同種型:PDHK1、PDHK2、PDHK 3 和 PDHK4。這些同種型中的每一種都具有不同的組織特異性分布。由于 LDHa 和 PDHKs 的表達都可以影響丙酮酸水平,并且之前已經(jīng)表明敲低 LDHa 表達可以降低乳酸水平,他們假設如果他們同時減少 LDHa 和 PDHKs 的表達CHO 細胞中,更多的丙酮酸可能會轉(zhuǎn)化為乙酰輔酶 A,從而增加這些細胞中 TCA 循環(huán)產(chǎn)生的能量。因此,LDHa 和 PDHK 的下調(diào)可能不僅會導致乳酸減少,還會導致 CHO 細胞中抗體產(chǎn)量增加。
在這項研究中,他們證明了使用單個 siRNA 靶向載體可以同時降低 LDHa 和 PDHK1、2 和 3 的表達。當他們同時降低 LDHa 和 PDHK1、2 和 3 基因表達,使用EKF Biosen C-Line 乳酸分析儀進行乳酸分析后,發(fā)現(xiàn)不僅乳酸水平大幅降低,抗體產(chǎn)量居然也增加了不少。
構(gòu)建靶向 LDHa 和 PDHK1、2、 3 的載體
LDHa 的靶向序列是根據(jù) Kim 和 Lee 的論文選擇的,LDHa siRNA 序列是 CTCGATTCCGTTATCTGAT。為了設計 PDHK 的 siRNA 靶向序列,CHO PDHK1、2 和 3 的部分 cDNA 序列通過逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應 (RT-PCR) 克隆,引物位于 PDHK 的高度保守區(qū)域內(nèi),部分克隆的序列也用于 siRNA 序列設計。
構(gòu)建靶向 PDHKs 和 LDHa 的 siRNA 載體
在哺乳動物細胞中報道了四種 PDHK 基因 。為了確定是否所有四種 PDHK 基因都在 CHO細胞中表達,基于人和小鼠 PDHK 序列之間的保守區(qū)域設計了四組 RT-PCR 引物。 PCR 結(jié)果顯示,即使在 CHO 細胞中可以檢測到所有四種 PDHK mRNA,但 PDHK4 mRNA 水平最低,并且遠低于 DHFR 缺陷型 CHO 細胞中的其他 3 種 PDHK(數(shù)據(jù)未顯示)。
實驗已經(jīng)證明,單獨降低 LDHa 基因表達能夠減少乳酸的產(chǎn)生。然而,盡管乳酸水平降低了 45-79%,但 Qp 和產(chǎn)物滴度沒有明顯改善,這表明在 CHO 細胞中單獨敲低 LDHa 不足以有效提高 Qp 和產(chǎn)物產(chǎn)量。
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