標(biāo)簽:引物設(shè)計(jì) 定量pcr pcr ct值 pcr實(shí)驗(yàn)室
PCR是現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)。PCR技術(shù)主要應(yīng)用于復(fù)制、測(cè)序或定量 DNA,簡(jiǎn)而言之,PCR(聚合酶鏈反應(yīng))是一種利用熱循環(huán)和酶來(lái)快速可靠地復(fù)制 DNA 的生化技術(shù)。
在進(jìn)行PCR實(shí)驗(yàn)前需要做以下準(zhǔn)備:
1. 聚合酶
聚合酶是一種酶,在適當(dāng)?shù)臈l件下,可以從模板 DNA 和核苷酸組裝新的 DNA 鏈。最初的 PCR 反應(yīng)很麻煩,因?yàn)槭?DNA 變性所需的高溫會(huì)殺死聚合酶。
這意味著在每次加熱循環(huán)后,必須手動(dòng)將新的聚合酶添加到反應(yīng)中。然而,在現(xiàn)代 PCR 中,這不是問(wèn)題,因?yàn)榫酆厦竿ǔ?lái)自兩種嗜熱細(xì)菌,即:棲熱菌或者烈性火球菌。
這些聚合酶分別稱為 Taq(發(fā)音為“tack”)和 Pfu(發(fā)音為“PFU”),可以輕松承受與 PCR 相關(guān)的高溫。正常情況下,目前市場(chǎng)上的商業(yè) Taq 和 Pfu 聚合酶已具備速度、保真度、持續(xù)合成能力(完成長(zhǎng)讀取的能力)以及讀取富含 GC 的模板的能力。可以根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)要求來(lái)來(lái)選擇不同Taq 酶。
2. 模板 DNA
這是您的聚合酶將讀取和復(fù)制的 DNA。您的模板 DNA 可以是基因組、質(zhì)?;?cDNA,但無(wú)論您的來(lái)源如何,質(zhì)量都很重要。模板 DNA 的完整性和純度越高,就越容易獲得良好的 PCR 結(jié)果。此外,請(qǐng)記住,理想的 DNA 量取決于您的來(lái)源,但通常每次 PCR 為 1 pg – 1 ng 質(zhì)粒 DNA 或 1 ng – 1 μg 基因組 DNA。
3. 引物
PCR技術(shù)中,引物合成也是重要的一環(huán)。引物是與模板 DNA 結(jié)合的合成 DNA 的短片段。
實(shí)驗(yàn)中通常需要設(shè)計(jì)兩個(gè)引物:一個(gè)“正向”引物和一個(gè)“反向”引物。
您的正向引物指定 PCR 的開始。該引物的序列與您的 5′-3′ 模板 DNA 序列相同。
您的反向引物指定您的 PCR 結(jié)束。該引物的序列是模板 DNA 的反向互補(bǔ)序列。
通常,引物長(zhǎng)度為 18-22 個(gè)堿基對(duì)。然而,比它們的長(zhǎng)度更重要的是它們的熔化溫度。
引物的熔解溫度應(yīng)為 54–60°C,并且彼此盡可能相似。
有很多在線計(jì)算器可以計(jì)算引物退火溫度,大多數(shù)合成引物的公司都提供此類計(jì)算器。
4. 核苷酸
作為 DNA 的單體,核苷酸是 DNA 復(fù)制所必需的。對(duì)于大多數(shù) DNA PCR,您將使用脫氧核苷三磷酸 (dNTP)。您可以單獨(dú)購(gòu)買這些產(chǎn)品,也可以將它們作為 dGTP、dCTP、dATP 和 dTTP 混合物購(gòu)買。
5. 緩沖液:
大多數(shù)商業(yè)聚合酶都提供了理想的緩沖液。這些緩沖液不僅提供正確的 pH 值,而且始終含有鎂、鉀或 DMSO 等添加劑,有助于優(yōu)化 DNA 變性、復(fù)性和聚合酶活性。
6. PCR儀:需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康膩?lái)選擇相對(duì)應(yīng)的PCR儀。近年來(lái),國(guó)產(chǎn)的PCR儀市場(chǎng)火熱,很多實(shí)驗(yàn)室中也較為常見(jiàn),比如:朗基的A300,T20,Q2000C等型號(hào)。
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