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組氨酸標(biāo)簽蛋白親和純化介質(zhì) Ni IDA Beads介紹
Ni IDA Beads可以用于各種表達(dá)來(lái)源(如大腸桿菌、酵母、昆蟲(chóng)細(xì)胞和哺乳動(dòng)物細(xì)胞)的組氨酸標(biāo)簽(6xHis-tagged)蛋白的純化。它是以4%瓊脂糖凝膠為基質(zhì),通過(guò)化學(xué)方法偶聯(lián)了三配位的亞氨基二乙酸(IDA),螯合鎳離子(Ni2+)后,可以形成比較穩(wěn)定的平面四邊形結(jié)構(gòu),從而有更多的位點(diǎn)與組氨酸標(biāo)簽上的咪唑環(huán)繼續(xù)配位,達(dá)到結(jié)合目的蛋白的效果。但是,這樣的結(jié)構(gòu)比較容易受到其他小分子的進(jìn)攻,鎳離子易被還原或者被螯合,從而破壞其化學(xué)結(jié)構(gòu),無(wú)法結(jié)合目的蛋白。Ni IDA Beads具有載量高,性能和價(jià)值匹配等優(yōu)點(diǎn)。
表1. Ni IDA Beads產(chǎn)品性能
項(xiàng)目 |
性能 |
基質(zhì) |
4%瓊脂糖凝膠 |
載量(/mL基質(zhì)) |
>40mg 6XHis-tagged protein |
微球粒徑(μm) |
45–165 |
最大壓力 |
0.1 MPa, 1 bar |
儲(chǔ)存緩沖液 |
含20% 乙醇的1XPBS |
儲(chǔ)存溫度 |
4°C-30°C |
2.純化流程
2.1 緩沖液的準(zhǔn)備
可使用下列推薦緩沖液,也可根據(jù)自己的使用習(xí)慣配置不同的緩沖液體系,基本原理就是低咪唑上樣,高咪唑洗脫。緩沖液在使用前盡量用0.22 μm 或者0.45 μm 濾膜過(guò)濾除菌。具體配置方法見(jiàn)表2。
2.2純化流程
2.2.1 細(xì)菌或酵母表達(dá)的蛋白
1)挑取單菌落到培養(yǎng)基中,根據(jù)載體使用說(shuō)明,加入相應(yīng)濃度的誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)相應(yīng)的時(shí)間。
2)表達(dá)結(jié)束后,將培養(yǎng)液轉(zhuǎn)移到離心杯中,7,000 rpm(7,500×g),離心15min 收集菌體,然后按照菌體∶Lysis Buffer=1∶10(WNV)加入
Lysis Buffer,加入終濃度為 1mM的 PMSF。加入溶菌酶(工作濃度為 0.2-0.4 mg/ml,如果表達(dá)的宿主細(xì)胞內(nèi)含 pLysS 或 pLysE,可以不加溶菌酶),同時(shí)也可加入其他蛋白酶抑制劑,但不能影響目的蛋白與樹(shù)脂的結(jié)合)。
3)將菌體沉淀懸浮起來(lái),(如果菌液濃度高,也可考慮加入10 ug/ml RNase A和5 μg/ml DNase I),混勻,放置于冰上,然后冰上超聲破
碎細(xì)胞,至菌液基本保持澄清。
4)將澄清的破碎液轉(zhuǎn)移至離心管中,10,000 rpm(15,000×g),4℃離心 20-30 min。取上清,置于冰上備用或-20℃保存。
2.2.2 酵母、昆蟲(chóng)和哺乳細(xì)胞分泌表達(dá)可溶性蛋白
1)將細(xì)胞培養(yǎng)液轉(zhuǎn)移至離心杯,5.000 rpm(3.800×g);離心10min,收集菌體得上清,如上清中不含 EDTA、組氨酸和還原劑等物質(zhì),即可直接加入柱子使用;如含有 EDTA、組氨酸和還原劑等物質(zhì),需用Lysis Buffer 透析才能加入柱子。2)對(duì)于大量體積的上清,需加入硫酸銨沉淀濃縮后,蛋白還需用 Lysis Buffer 透析后才能加入柱子。
2.3 Ni IDA Beads 重力柱的裝填
1)取合適規(guī)格的重力層析柱,裝入下墊片,加入適量純水潤(rùn)洗柱管和墊片,關(guān)閉下出口。
2)將 Ni IDA Beads 混合均勻,用槍頭吸取適量漿液加入至重力柱中(介質(zhì)實(shí)際體積占懸液的一半),打開(kāi)下出口流干保護(hù)液。
3)加入適量純水沖洗介質(zhì),待柱管中液體重力流干后,關(guān)閉下出口。
4)裝入潤(rùn)洗后的上墊片,確保墊片與填料之前沒(méi)有空隙,且保持水平。
5)裝填好的重力柱可以直接加入平衡液進(jìn)行平衡,暫不使用時(shí)則加入保護(hù)液,4-30℃保存。
2.4 樣品純化流程
2.4.1 孵育法純化
1)根據(jù)純化的樣品量,取適量 Ni IDA Beads加入離心管中,1000 rpm 離心 1min,吸棄上清;也可加入重力柱中,流干保護(hù)液。2)向離心管中加入5倍介質(zhì)體積的Lysis Buffer 清洗介質(zhì),1000 rpm 離心1min,吸棄上清;如使用重力柱,則直接在重力柱中清洗,直接重力流干Lysis Buffer;重復(fù)兩次以上。
3)加入樣品,封閉離心管或重力柱管,4℃振蕩孵育2-4 h 或者37℃孵育30 min-2 h。
4)孵育結(jié)束后,1000 rpm 離心1 min,吸棄上清,或過(guò)濾收集介質(zhì),上清保留作為流穿,用于電泳鑒定。
5)用5倍介質(zhì)體積的Wash Buffer 清洗介質(zhì),1000 rpm 離心 1min 或重力柱管過(guò)濾,去除上清(注意不要吸到介質(zhì)),重復(fù)3-5次,中間建議更換新離心管。必要時(shí)可以調(diào)整咪唑的濃度進(jìn)行洗雜。
6)加入3-5倍柱體積的 Elution Buffer 進(jìn)行洗脫,室溫孵育10-15 min,1000 rpm 離心1min 或重力柱管收集洗脫液,可重復(fù)2-3次。
2.4.2 重力柱法純化
1)將裝填好的 Ni IDA Beads 重力柱用5倍柱體積 Lysis Buffer 進(jìn)行平衡,使填料處于與目的蛋白相同的緩沖液體系下,重復(fù) 2-3次。
2)將樣品加到平衡好的重力柱中,樣品保留時(shí)間至少2 min;保證樣品和介質(zhì)充分接觸,收集流出液,可以反復(fù)上樣增加結(jié)合效率。
3)用 10-15倍柱體積的 Wash Buffer 進(jìn)行洗雜,去除非特異性吸附的雜蛋白,收集洗雜液。必要時(shí)可以調(diào)整咪唑的濃度進(jìn)行洗雜。
4)使用5-10倍柱體積的 Elution Buffer 洗脫,分段收集,每一個(gè)柱體積收集一管,分別檢測(cè),既可以保證所有結(jié)合的目的蛋白被洗脫,又可以得到高純度和高濃度的蛋白。
上述步驟介質(zhì)洗脫結(jié)束后,先用Lysis Buffer 沖洗3倍柱體積,然后用純水沖洗5倍柱體積,再用 20%乙醇沖洗2個(gè)柱體積,然后將介質(zhì)置于2-8℃保存。2.5 SDS-PAGE 檢測(cè)
將使用純化產(chǎn)品得到的樣品(包括流出組分、洗雜組分和洗脫組分)以及原始樣品使用 SDS-PAGE檢測(cè)純化效果。
3.在位清洗
當(dāng)填料使用過(guò)程中發(fā)現(xiàn)反壓過(guò)高或者填料上面出現(xiàn)明顯的污染時(shí),需要進(jìn)行在位清洗操作(Cleaning-in-Place,CIP)。
建議按照下面操作去除填料上殘留的污染物,如沉淀蛋白、疏水蛋白和脂蛋白等。
去除強(qiáng)疏水結(jié)合的蛋白,脂蛋白和脂類
通過(guò)使用 30%異丙醇清洗 5-10個(gè)柱體積,接觸時(shí)間為 15-20 min 可以去除此類污染物。然后,再使用 10倍柱體積的去離子水清洗。也可以選擇使用含有去污劑的酸性或堿性溶液,清洗填料 2倍柱體積。例如,含有0.1-0.5%非離子去污劑的 0.1 M 醋酸溶液,接觸時(shí)間為 1-2 小時(shí)。去污劑處理后。需要使用70%的乙醇清洗5個(gè)柱體積。以徹切底去除去污劑。最后使用10倍柱體積的夫離子水清洗。
去除離子作用結(jié)合的蛋白
使用 1.5M NaCI溶液清洗 10-15 min。然后,再使用去離子水清洗 10個(gè)柱體積。
4.填料再生
組氨酸標(biāo)簽蛋白親和純化填料所帶的鎳離子不需要經(jīng)常螯合去除和重新掛鎳離子。當(dāng)填料使用過(guò)程中發(fā)現(xiàn)顏色變淺,或者填料載量明顯變低時(shí),需要進(jìn)行對(duì)填料進(jìn)行鎳離子剝離和重新掛鎳離子,也就是填料再生。將填料裝填在合適的層析柱內(nèi),按照下面操作流程進(jìn)行鎳離子剝離和重新掛鎳離子。
1)使用5倍柱體積去離子水清洗填料;
2)使用5倍柱體積100 mM EDTA(pH 8.0)剝落鎳離子;
3)使用10倍柱體積去離子水清洗填料;
4)使用0.5M NaOH清洗5倍柱體積,停留 10-15min;
5)使用去離子水清洗填料,直至 pH中性;
6)使用 3-5倍柱體積 100 mM NiSO4再生掛鎳;
7)使用10倍柱體積去離子水清洗;
填料再生后,可以立即使用,如不立即使用,需要將填料懸浮干等體積的 20%乙醇中,置于2-8°℃保存。
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