一、定義和概念
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類器官分選
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類器官是一種三維(3D)細胞培養(yǎng)物,它是由干細胞或者器官祖細胞在體外自組織形成的,具有和體內(nèi)器官相似的結(jié)構(gòu)和功能。類器官分選主要是指從復雜的培養(yǎng)體系中分離出目標類器官,這些培養(yǎng)體系可能包含未形成類器官的細胞團、單個細胞以及不同發(fā)育階段或不同類型的類器官。
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例如,在腸道類器官培養(yǎng)中,會有大小、成熟度不同的類器官,分選就是要把符合特定要求(如尺寸合適、形態(tài)完整、具有特定細胞類型標記等)的腸道類器官挑選出來用于后續(xù)研究,如藥物篩選或者發(fā)育機制研究。
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單細胞分選
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單細胞分選是指從細胞群體(如組織樣本、細胞系培養(yǎng)物)中分離出單個細胞的技術(shù)。目的是對每個獨立的細胞進行單獨的分析或者培養(yǎng),以了解細胞間的異質(zhì)性。
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比如,在腫瘤組織中,細胞存在多種狀態(tài),包括腫瘤干細胞、增殖細胞、分化細胞等。單細胞分選可以將這些不同類型的細胞單個地分離開,進而研究每個細胞的基因表達、代謝狀態(tài)等特性。
二、分選的對象和尺度
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類器官分選
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分選對象是相對較大的類器官結(jié)構(gòu),其大小通常在幾十微米到幾百微米不等。這些類器官包含多種細胞類型,它們以組織樣的結(jié)構(gòu)組合在一起。
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例如,腦類器官可能包含神經(jīng)干細胞、神經(jīng)元、神經(jīng)膠質(zhì)細胞等多種細胞,它們相互作用形成類似大腦組織的分層和神經(jīng)回路結(jié)構(gòu)。分選時是對這種復雜的、多細胞的微型器官整體進行操作。
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單細胞分選
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分選對象是單個細胞,細胞大小一般在幾微米到幾十微米。主要關(guān)注的是獨立的細胞個體,不考慮細胞之間已形成的復雜組織結(jié)構(gòu)。
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例如,血細胞中的紅細胞直徑約為 7 - 8 微米,白細胞大小不一但一般在 7 - 20 微米左右,單細胞分選技術(shù)能夠精確地從血液樣本中分離出單個紅細胞或者白細胞。
三、分選技術(shù)和原理
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類器官分選
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基于大小和形態(tài)的分選方法
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可以使用濾網(wǎng)過濾的方式。例如,根據(jù)類器官的大小選擇合適孔徑的濾網(wǎng),將較小的細胞碎片和單個細胞過濾掉,留下大小符合要求的類器官。
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還有微流體技術(shù),通過設(shè)計特殊的微通道,讓類器官在流體動力的作用下,根據(jù)大小和形狀在不同的通道分支中被分離。
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基于標記物的分選方法
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如果類器官表達特定的細胞表面標記蛋白,可以利用免疫磁珠分選。將針對目標標記蛋白的抗體偶聯(lián)到磁珠上,然后讓帶有磁珠的抗體與類器官結(jié)合。在磁場的作用下,標記了磁珠的類器官就可以被分離出來。
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單細胞分選
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熒光激活細胞分選(FACS)
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這是一種廣泛使用的技術(shù)。細胞先被標記上熒光染料,這些染料可以結(jié)合到細胞表面的標記物或者細胞內(nèi)的成分上。當細胞逐個通過激光檢測區(qū)域時,根據(jù)熒光信號的強度和其他光學特性(如前向散射光和側(cè)向散射光,分別代表細胞的大小和內(nèi)部復雜性),儀器可以對細胞進行分類。帶有特定熒光標記的細胞會被充電并在電場的作用下偏轉(zhuǎn)到不同的收集管中。
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微流控單細胞分選技術(shù)
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基于微流控芯片,通過精確控制液體的流動來實現(xiàn)單細胞的捕獲和分離。例如,利用微閥或者微阱結(jié)構(gòu),當細胞在微流控通道中流動時,單個細胞可以被捕獲到特定的位置,然后再通過改變流體壓力等方式將其釋放到收集區(qū)域。
四、應用場景
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類器官分選
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疾病建模和藥物篩選
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分選后的類器官可以用于建立疾病模型。例如,從患者誘導多能干細胞(iPSC)分化得到的類器官,經(jīng)過分選得到病變特征明顯的類器官,用于研究疾病發(fā)生機制。在藥物篩選方面,分選大小和發(fā)育階段一致的類器官可以提高藥物篩選的準確性和重復性。
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再生醫(yī)學研究
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用于篩選高質(zhì)量的類器官用于移植研究。例如,在肝臟類器官移植研究中,分選功能完整、免疫原性低的類器官是關(guān)鍵步驟,有助于提高移植后的成活率和功能恢復。
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單細胞分選
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細胞異質(zhì)性研究
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在腫瘤研究中,通過單細胞分選后進行單細胞測序,可以揭示腫瘤細胞群體內(nèi)部不同細胞亞群的基因表達差異,幫助理解腫瘤的演化和耐藥機制。
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干細胞研究
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對于干細胞的分化研究,單細胞分選可以跟蹤單個干細胞的分化軌跡。例如,分選造血干細胞后,觀察其在不同培養(yǎng)條件下向各種血細胞的分化過程,包括基因表達的動態(tài)變化和細胞功能的獲得。
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